Описание
Bacterial diversity of the Mekong River in Thailand during March - early December 2021 was derived from 16S rRNA metabarcode sequences. All DNA samples were sequenced using Illumina platform. QIIME2 was employed to assign taxonomic classification of OTUs.
The data and information were provided from LMC MekongDNA project (https://mekongdna.org/).
The sampling events of the Lancang-Mekong microbiome project are published to GBIF sampling dataset UUID: 77c5d29c-2c6e-4d01-bc66-eb23c274c73f ( https://doi.org/10.15468/drf547 ).
Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 12 614 записей.
Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Thailand Bioresource Research Center (TBRC). Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0).
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 2df7ae37-2ff6-4328-92bb-e17b7028dd75. Thailand Bioresource Research Center (TBRC) отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Participant Node Managers Committee.
Ключевые слова
Occurrence
Контакты
- ●
- Metadata Provider ●
- Originator ●
- Point Of Contact
- Researcher
- 113 Thailand Science Park Phahonyothin Road Khlong Nueng, Khlong Luang Pathum Thani 12120
Географический охват
The hydrological stations along the Mekong River in Thailand
| Ограничивающие координаты | Юг Запад [14,669, 100,1], Север Восток [20,26, 105,776] |
|---|
Таксономический охват
Описание отсутсвует
| Kingdom | Bacteria |
|---|
Временной охват
| Дата начала / Дата окончания | 2021-03-16 / 2021-11-30 |
|---|
Данные проекта
Freshwater ecosystems exert great impact on human livelihoods. Mekong River system is a regional water resource shared by China, Myanmar, Thailand, Lao PDR, Cambodia, and Vietnam. Biodiversity of river microbes have a potential for assessment and monitoring of environmental conditions in freshwater ecosystems. However, generating biodiversity data based on traditional sampling and morphological identification is time-consuming and error-prone. Recently, metabarcoding of environmental DNA (eDNA) technique offers novel opportunities. It is non-invasive, cost-effective method to accurately assess biodiversity and bioindicators with the aid of advanced Next Generation Sequencing (NGS) and High-throughput Sequencing (HTS) technologies. However, the metabarcoding studies and eDNA data in Mekong River are very scarce.
| Название | Microbial metabarcode database of Mekong river |
|---|---|
| Идентификатор | BIFA6_030 |
| Финансирование | The project is supported by BIFA Collections Data Mobilization Grant (BIFA 2020). |
| Описание района исследования | The eDNA samples were taken from the Mekong River. |
Исполнители проекта:
Дополнительные метаданные
The sampling events of the Lancang-Mekong microbiome project are published to GBIF sampling dataset UUID: 77c5d29c-2c6e-4d01-bc66-eb23c274c73f ( https://doi.org/10.15468/drf547 ).
| Альтернативные идентификаторы | https://cloud.gbif.org/asia/resource?r=mekongdna1-3 |
|---|