Descrição
Bacterial diversity of the Mekong River in Thailand during March - early December 2021 was derived from 16S rRNA metabarcode sequences. All DNA samples were sequenced using Illumina platform. QIIME2 was employed to assign taxonomic classification of OTUs.
The data and information were provided from LMC MekongDNA project (https://mekongdna.org/).
The sampling events of the Lancang-Mekong microbiome project are published to GBIF sampling dataset UUID: 77c5d29c-2c6e-4d01-bc66-eb23c274c73f ( https://doi.org/10.15468/drf547 ).
Registros de Dados
Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 12.614 registros.
Também existem 1 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.
This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.
Versões
A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.
Direitos
Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:
O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Thailand Bioresource Research Center (TBRC). This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0) License.
GBIF Registration
Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 2df7ae37-2ff6-4328-92bb-e17b7028dd75. Thailand Bioresource Research Center (TBRC) publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por Participant Node Managers Committee.
Palavras-chave
Occurrence
Contatos
- ●
- Provedor Dos Metadados ●
- Originador ●
- Ponto De Contato
- Researcher
- 113 Thailand Science Park Phahonyothin Road Khlong Nueng, Khlong Luang Pathum Thani 12120
Cobertura Geográfica
The hydrological stations along the Mekong River in Thailand
| Coordenadas delimitadoras | Sul Oeste [14,669, 100,1], Norte Leste [20,26, 105,776] |
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Cobertura Taxonômica
Nenhuma descrição disponível
| Reino | Bacteria |
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Cobertura Temporal
| Data Inicial / Data final | 2021-03-16 / 2021-11-30 |
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Dados Sobre o Projeto
Freshwater ecosystems exert great impact on human livelihoods. Mekong River system is a regional water resource shared by China, Myanmar, Thailand, Lao PDR, Cambodia, and Vietnam. Biodiversity of river microbes have a potential for assessment and monitoring of environmental conditions in freshwater ecosystems. However, generating biodiversity data based on traditional sampling and morphological identification is time-consuming and error-prone. Recently, metabarcoding of environmental DNA (eDNA) technique offers novel opportunities. It is non-invasive, cost-effective method to accurately assess biodiversity and bioindicators with the aid of advanced Next Generation Sequencing (NGS) and High-throughput Sequencing (HTS) technologies. However, the metabarcoding studies and eDNA data in Mekong River are very scarce.
| Título | Microbial metabarcode database of Mekong river |
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| Identificador | BIFA6_030 |
| Financiamento | The project is supported by BIFA Collections Data Mobilization Grant (BIFA 2020). |
| Descrição da Área de Estudo | The eDNA samples were taken from the Mekong River. |
O pessoal envolvido no projeto:
Metadados Adicionais
The sampling events of the Lancang-Mekong microbiome project are published to GBIF sampling dataset UUID: 77c5d29c-2c6e-4d01-bc66-eb23c274c73f ( https://doi.org/10.15468/drf547 ).
| Identificadores alternativos | https://cloud.gbif.org/asia/resource?r=mekongdna1-3 |
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