Descripción
Bacterial diversity of the Mekong River in Thailand during March - early December 2021 was derived from 16S rRNA metabarcode sequences. All DNA samples were sequenced using Illumina platform. QIIME2 was employed to assign taxonomic classification of OTUs.
The data and information were provided from LMC MekongDNA project (https://mekongdna.org/).
The sampling events of the Lancang-Mekong microbiome project are published to GBIF sampling dataset UUID: 77c5d29c-2c6e-4d01-bc66-eb23c274c73f ( https://doi.org/10.15468/drf547 ).
Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 12.614 registros.
también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.
Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.
Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
Derechos
Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:
El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Thailand Bioresource Research Center (TBRC). Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento-NoComercial (CC-BY-NC 4.0).
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 2df7ae37-2ff6-4328-92bb-e17b7028dd75. Thailand Bioresource Research Center (TBRC) publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Participant Node Managers Committee.
Palabras clave
Occurrence
Contactos
- ●
- Proveedor De Los Metadatos ●
- Originador ●
- Punto De Contacto
- Researcher
- 113 Thailand Science Park Phahonyothin Road Khlong Nueng, Khlong Luang Pathum Thani 12120
Cobertura geográfica
The hydrological stations along the Mekong River in Thailand
| Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [14,669, 100,1], Latitud Máxima Longitud Máxima [20,26, 105,776] |
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Cobertura taxonómica
No hay descripción disponible
| Reino | Bacteria |
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Cobertura temporal
| Fecha Inicial / Fecha Final | 2021-03-16 / 2021-11-30 |
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Datos del proyecto
Freshwater ecosystems exert great impact on human livelihoods. Mekong River system is a regional water resource shared by China, Myanmar, Thailand, Lao PDR, Cambodia, and Vietnam. Biodiversity of river microbes have a potential for assessment and monitoring of environmental conditions in freshwater ecosystems. However, generating biodiversity data based on traditional sampling and morphological identification is time-consuming and error-prone. Recently, metabarcoding of environmental DNA (eDNA) technique offers novel opportunities. It is non-invasive, cost-effective method to accurately assess biodiversity and bioindicators with the aid of advanced Next Generation Sequencing (NGS) and High-throughput Sequencing (HTS) technologies. However, the metabarcoding studies and eDNA data in Mekong River are very scarce.
| Título | Microbial metabarcode database of Mekong river |
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| Identificador | BIFA6_030 |
| Fuentes de Financiación | The project is supported by BIFA Collections Data Mobilization Grant (BIFA 2020). |
| Descripción del área de estudio | The eDNA samples were taken from the Mekong River. |
Personas asociadas al proyecto:
Metadatos adicionales
The sampling events of the Lancang-Mekong microbiome project are published to GBIF sampling dataset UUID: 77c5d29c-2c6e-4d01-bc66-eb23c274c73f ( https://doi.org/10.15468/drf547 ).
| Identificadores alternativos | https://cloud.gbif.org/asia/resource?r=mekongdna1-3 |
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