Description
Bacterial diversity of the Mekong River in Thailand during March - early December 2021 was derived from 16S rRNA metabarcode sequences. All DNA samples were sequenced using Illumina platform. QIIME2 was employed to assign taxonomic classification of OTUs.
The data and information were provided from LMC MekongDNA project (https://mekongdna.org/).
The sampling events of the Lancang-Mekong microbiome project are published to GBIF sampling dataset UUID: 77c5d29c-2c6e-4d01-bc66-eb23c274c73f ( https://doi.org/10.15468/drf547 ).
Enregistrements de données
Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 12 614 enregistrements.
1 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Thailand Bioresource Research Center (TBRC). Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 2df7ae37-2ff6-4328-92bb-e17b7028dd75. Thailand Bioresource Research Center (TBRC) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Participant Node Managers Committee.
Mots-clé
Occurrence
Contacts
- ●
- Fournisseur Des Métadonnées ●
- Créateur ●
- Personne De Contact
- Researcher
- 113 Thailand Science Park Phahonyothin Road Khlong Nueng, Khlong Luang Pathum Thani 12120
Couverture géographique
The hydrological stations along the Mekong River in Thailand
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [14,669, 100,1], Nord Est [20,26, 105,776] |
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Couverture taxonomique
Pas de description disponible
| Kingdom | Bacteria |
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Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 2021-03-16 / 2021-11-30 |
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Données sur le projet
Freshwater ecosystems exert great impact on human livelihoods. Mekong River system is a regional water resource shared by China, Myanmar, Thailand, Lao PDR, Cambodia, and Vietnam. Biodiversity of river microbes have a potential for assessment and monitoring of environmental conditions in freshwater ecosystems. However, generating biodiversity data based on traditional sampling and morphological identification is time-consuming and error-prone. Recently, metabarcoding of environmental DNA (eDNA) technique offers novel opportunities. It is non-invasive, cost-effective method to accurately assess biodiversity and bioindicators with the aid of advanced Next Generation Sequencing (NGS) and High-throughput Sequencing (HTS) technologies. However, the metabarcoding studies and eDNA data in Mekong River are very scarce.
| Titre | Microbial metabarcode database of Mekong river |
|---|---|
| Identifiant | BIFA6_030 |
| Financement | The project is supported by BIFA Collections Data Mobilization Grant (BIFA 2020). |
| Description du domaine d'étude / de recherche | The eDNA samples were taken from the Mekong River. |
Les personnes impliquées dans le projet:
Métadonnées additionnelles
The sampling events of the Lancang-Mekong microbiome project are published to GBIF sampling dataset UUID: 77c5d29c-2c6e-4d01-bc66-eb23c274c73f ( https://doi.org/10.15468/drf547 ).
| Identifiants alternatifs | https://cloud.gbif.org/asia/resource?r=mekongdna1-3 |
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