説明
Bacterial diversity of the Mekong River in Thailand during March - early December 2021 was derived from 16S rRNA metabarcode sequences. All DNA samples were sequenced using Illumina platform. QIIME2 was employed to assign taxonomic classification of OTUs.
The data and information were provided from LMC MekongDNA project (https://mekongdna.org/).
The sampling events of the Lancang-Mekong microbiome project are published to GBIF sampling dataset UUID: 77c5d29c-2c6e-4d01-bc66-eb23c274c73f ( https://doi.org/10.15468/drf547 ).
データ レコード
この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、12,614 レコードが含まれています。
拡張データ テーブルは1 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。
この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。
バージョン
次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。
権利
研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:
パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Thailand Bioresource Research Center (TBRC)。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC 4.0) License.
GBIF登録
このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 2df7ae37-2ff6-4328-92bb-e17b7028dd75が割り当てられています。 Participant Node Managers Committee によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているThailand Bioresource Research Center (TBRC) が、このリソースをパブリッシュしました。
キーワード
Occurrence
連絡先
- ●
- メタデータ提供者 ●
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- Researcher
- 113 Thailand Science Park Phahonyothin Road Khlong Nueng, Khlong Luang Pathum Thani 12120
地理的範囲
The hydrological stations along the Mekong River in Thailand
| 座標（緯度経度） | 南 西 [14.669, 100.1], 北 東 [20.26, 105.776] |
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生物分類学的範囲
説明がありません
| Kingdom | Bacteria |
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時間的範囲
| 開始日 / 終了日 | 2021-03-16 / 2021-11-30 |
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プロジェクトデータ
Freshwater ecosystems exert great impact on human livelihoods. Mekong River system is a regional water resource shared by China, Myanmar, Thailand, Lao PDR, Cambodia, and Vietnam. Biodiversity of river microbes have a potential for assessment and monitoring of environmental conditions in freshwater ecosystems. However, generating biodiversity data based on traditional sampling and morphological identification is time-consuming and error-prone. Recently, metabarcoding of environmental DNA (eDNA) technique offers novel opportunities. It is non-invasive, cost-effective method to accurately assess biodiversity and bioindicators with the aid of advanced Next Generation Sequencing (NGS) and High-throughput Sequencing (HTS) technologies. However, the metabarcoding studies and eDNA data in Mekong River are very scarce.
| タイトル | Microbial metabarcode database of Mekong river |
|---|---|
| 識別子 | BIFA6_030 |
| ファンデイング | The project is supported by BIFA Collections Data Mobilization Grant (BIFA 2020). |
| Study Area Description | The eDNA samples were taken from the Mekong River. |
プロジェクトに携わる要員:
追加のメタデータ
The sampling events of the Lancang-Mekong microbiome project are published to GBIF sampling dataset UUID: 77c5d29c-2c6e-4d01-bc66-eb23c274c73f ( https://doi.org/10.15468/drf547 ).