Plantas Vasculares del Uruguay (Observaciones Fagúndez-Pachón)

Ocorrência
Versão mais recente published by Biodiversidata on jul 14, 2020 Biodiversidata
Publication date:
14 de julho de 2020
Published by:
Biodiversidata
Licença:
CC-BY 4.0

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Descrição

Este conjunto de datos contiene registros primarios de especies de plantas vasculares documentadas por César Fagúndez-Pachón. Incluye 383 observaciones de 208 especies, realizadas en 2003 y entre 2016 y 2019, en 12 localidades del Uruguay. Estos datos forman parte de la base de datos de plantas vasculares de Biodiversidata, el Consorcio de Datos de Biodiversidad del Uruguay.

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 383 registros.

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Fagúndez-Pachón C, Grattarola F (2020): Plantas Vasculares del Uruguay (Observaciones Fagúndez-Pachón). v1.2. Biodiversidata. Dataset/Occurrence. https://cloud.gbif.org/lac/resource?r=plantas_cesarfagundez&v=1.2

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Biodiversidata. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 90a5be66-f51f-4a7e-9ffe-3137c7d3e0c3.  Biodiversidata publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por GBIF Uruguay.

Palavras-chave

Occurrence; Observation; Uruguay; Vascular Plants; Pampean province

Contatos

César Fagúndez-Pachón
  • Provedor De Conteúdo
  • Originador
Profesor Asistente
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República
Rocha
Rocha
UY
Florencia Grattarola
  • Provedor Dos Metadados
  • Custódio De Dados
  • Originador
  • Distribuidor
  • Ponto De Contato
Coordinadora y Data Manager
Biodiversidata
UY
César Fagúndez-Pachón
  • Provedor De Conteúdo
  • Originador
Asistente
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República
Rocha
Rocha
UY

Cobertura Geográfica

La cobertura geográfica incluye 12 sitios en los departamentos de Rocha, San José, Durazno y Río Negro, en Uruguay

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [-34,673, -58,045], Norte Leste [-32,853, -53,762]

Cobertura Taxonômica

Se registraron un total de 208 especies de plantas vasculares (187 nativas), 74 familias y 189 géneros.

Filo Tracheophyta (Plantas Vasculares)
Class Magnoliopsida, Liliopsida, Gnetopsida, Lycopodiopsida, Polypodiopsida

Cobertura Temporal

Data Inicial / Data final 2003-01-01 / 2019-01-01

Dados Sobre o Projeto

Biodiversidata, el Consorcio de Datos de Biodiversidad del Uruguay (https://biodiversidata.org/) tiene como objetivo reunir una base de datos primarios en constante crecimiento de la diversidad de especies del Uruguay y ponerla a disposición de manera abierta y accesible. En una primera etapa el trabajo se orientó a los datos de vertebrados (Grattarola et al. 2019). La segunda etapa de este proyecto está enfocada en la recolección de datos de plantas vasculares. Estos datos se publicarán en un data paper y posteriormente serán utilizados para responder una serie de preguntas científicas relativas a los patrones de distribución de las plantas en Uruguay. Las principales preguntas de investigación que estamos abordando son: i) ¿Dónde se encuentran los hotspots de biodiversidad en Uruguay? A nivel general y en los principales grupos de biodiversidad; ii) ¿Puede esta evidencia ser útil para redirigir las estrategias de conservación actuales?

Título Biodiversidata: Diversidad de especies de plantas vasculares en Uruguay
Identificador Biodiversidata_Plants
Financiamento El proyecto Biodiversidata es coordinado por Florencia Grattarola con una beca de doctorado de la Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII) – Grant POS_EXT_2016_1_136663.
Descrição da Área de Estudo Abarca registros de presencia de especies en todo el territorio nacional.
Descrição do Design Los datos de observaciones proporcionados por las/os integrantes de Biodiversidata fueron estandarizados e integrados a la base de datos del grupo de las plantas vasculares de Biodiversidata. El producto final consiste en una base de datos que incluye además datos extraídos de bibliografía y datos obtenidos a partir de bases de datos online. La base de datos general contiene tanto registros realizados durante el monitoreo de grupos específicos como registros de eventos de muestreo no sistemáticos. Los registros consisten principalmente en observaciones humanas y en algunos casos se colectaron especímenes que están preservados en colecciones de Uruguay.

O pessoal envolvido no projeto:

Florencia Grattarola

Métodos de Amostragem

El conjunto de datos reúne observaciones hechas en muestreos sistemáticos y no sistemáticos por César Fagúndez-Pachón.

Área de Estudo 12 sitios distribuidos en los departamentos de Rocha, San José, Durazno y Río Negro en Uruguay, en 2003 y 2019en el período entre 2016 y 2019.
Controle de Qualidade Se chequearon errores en los nombres científicos, localización geográfica y fechas de muestreo. Se agregaron datos sobre la autoría de los nombres científicos y se completaron los rangos taxonómicos desde Reino hasta el rango infraespecífico, se incluyó el término ‘taxonRank’ con información sobre el nivel de detalle de cada taxón. Se asignó a cada registro el nivel administrativo de Departamento y se incorporaron datos sobre la incertidumbre y precisión de la localización geográfica. El código de R utilizado para la limpieza de datos está disponible en nuestro repositorio de GitHub (https://github.com/bienflorencia/rBiodiversidata).

Descrição dos passos do método:

  1. Verificación de errores ortográficos de nombres científicos usando los paquetes de R 'taxize' (Chamberlain et al. 2020) y 'WorldFlora' (Kindt 2020). Para verificar los nombres primero contrastamos la lista de especies con la referencia taxonómica de World Flora Online (WFO) (http://www.worldfloraonline.org/), si la especie o su sinónimo sugeridos por WFO fuera aceptado según Zuloaga et al. (2019) en Darwinion (http://www.darwin.edu.ar), conservamos el nombre y el ‘taxonID’ de WFO, de lo contrario, utilizamos el nombre de Darwinion y buscamos una ‘taxonID’ en Tropicos (https://www.tropicos.org/). El nombre original de la especie se mantuvo bajo el término ‘previousIdentifications’. La lista final de nombres científicos fue verificada por los expertos en plantas de Biodiversidata.
  2. Determinación de rangos taxonómicos superiores (Reino, Filo, Clase, Orden, Familia y Género), inclusión del término de rango infraespecífico y la autoridad taxonómica para los nombres científicos.
  3. Incorporación del término ‘establishmentMeans’ categorizando a las especies en nativas o introducidas según Andrade et al. (2018).
  4. Verificación de valores atípicos o inexactos en la localización geográfica. Incorporación de los campos de incertidumbre y precisión para los valores de latitud y longitud proporcionados.
  5. Estandarización del estado/provincia geográfica a través de la base de datos del GeoNames Gazetteer utilizando el paquete R 'geonames' (Rowlingson 2019). Inclusión de términos estándares para los rangos geográficos más altos que el nivel de localidad (continente y país).

Citações bibliográficas

  1. Andrade BO, Marchesi E, Burkart S, Setubal RB, Lezama F, Perelman S, Schneider AA, Trevisan R, Overbeck GE, Boldrini II (2018) Vascular plant species richness and distribution in the Río de la Plata grasslands. Botanical Journal of the Linnean Society 188: 6. https://doi.org/10.1093/botlinnean/boy063
  2. Chamberlain S, Szoecs E, Foster Z, Arendsee Z, Boettiger C, Ram K, Bartomeus I, Baumgartner J, O'Donnell J, Oksanen J, Tzovaras BG, Marchand P, Tran V, Salmon M, Li G, Grenié M (2020) taxize: Taxonomic information from around the web. R package version 0.9.92. https://cran.r-project.org/web/packages/taxize
  3. Fagúndez C (2003) La vegetación de un blanqueal en el litoral oeste del Uruguay: efectos de la hormiga Atta vollenweideri Forel. Trabajo final de Licenciatura en ciencias biológicas, opción Botánica. Facultad de Ciencias, UdelaR, Montevideo-Uruguay. 28pp. http://www.guayubira.org.uy/monte/bibliografia/FagundezBlanqueal.pdf
  4. Grattarola F, Botto G, da Rosa I, Gobel N, González EM, González J, Hernández D, Laufer G, Maneyro R, Martínez-Lanfranco JA, Naya DE, Rodales AL, Ziegler L, Pincheira-Donoso D (2019) Biodiversidata: An Open-Access Biodiversity Database for Uruguay. Biodiversity Data Journal 7. https://doi.org/10.3897/BDJ.7.e36226
  5. Kindt R (2020) WorldFlora: An R package for exact and fuzzy matching of plant names against the World Flora Online Taxonomic Backbone data. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2020.02.02.930719
  6. Rowlingson B (2019) Interface to the "Geonames" Spatial Query Web Service. R package version 0.999. https://cran.r-project.org/web/packages/geonames/
  7. Zuloaga FO, Belgrano MJ, Zanotti CA (2019) Actualización del Catálogo de las Plantas Vasculares del Cono Sur. Darwiniana, nueva serie 7: 70. https://doi.org/10.14522/darwiniana.2019.72.861

Metadados Adicionais

Identificadores alternativos 90a5be66-f51f-4a7e-9ffe-3137c7d3e0c3
https://cloud.gbif.org/lac/resource?r=plantas_cesarfagundez