Plantas Vasculares del Uruguay (Observaciones Fagúndez-Pachón)

オカレンス（観察データと標本)
最新バージョン Biodiversidata により出版 7月 14, 2020 Biodiversidata
ホーム:
https://biodiversidata.org/
公開日:
2020年7月14日
公開者:
Biodiversidata
ライセンス:
CC-BY 4.0

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説明

Este conjunto de datos contiene registros primarios de especies de plantas vasculares documentadas por César Fagúndez-Pachón. Incluye 383 observaciones de 208 especies, realizadas en 2003 y entre 2016 y 2019, en 12 localidades del Uruguay. Estos datos forman parte de la base de datos de plantas vasculares de Biodiversidata, el Consorcio de Datos de Biodiversidad del Uruguay.

データ レコード

この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、383 レコードが含まれています。

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Fagúndez-Pachón C, Grattarola F (2020): Plantas Vasculares del Uruguay (Observaciones Fagúndez-Pachón). v1.2. Biodiversidata. Dataset/Occurrence. https://cloud.gbif.org/lac/resource?r=plantas_cesarfagundez&v=1.2

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Biodiversidata。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 90a5be66-f51f-4a7e-9ffe-3137c7d3e0c3が割り当てられています。   GBIF Uruguay によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているBiodiversidata が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence; Observation; Uruguay; Vascular Plants; Pampean province

連絡先

César Fagúndez-Pachón
  • データ提供者 ●
  • 最初のデータ採集者
Profesor Asistente
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República
Rocha
Rocha
UY
Florencia Grattarola
  • メタデータ提供者 ●
  • Custodiansteward(保管者） ●
  • 最初のデータ採集者 ●
  • データ配布者 ●
  • 連絡先
Coordinadora y Data Manager
Biodiversidata
UY
https://flograttarola.com/
http://orcid.org/0000-0001-8282-5732
César Fagúndez-Pachón
  • データ提供者 ●
  • 最初のデータ採集者
Asistente
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República
Rocha
Rocha
UY

地理的範囲

La cobertura geográfica incluye 12 sitios en los departamentos de Rocha, San José, Durazno y Río Negro, en Uruguay

座標（緯度経度） 南 西 [-34.673, -58.045], 北 東 [-32.853, -53.762]

生物分類学的範囲

Se registraron un total de 208 especies de plantas vasculares (187 nativas), 74 familias y 189 géneros.

Phylum Tracheophyta (Plantas Vasculares)
Class Magnoliopsida, Liliopsida, Gnetopsida, Lycopodiopsida, Polypodiopsida

時間的範囲

開始日 / 終了日 2003-01-01 / 2019-01-01

プロジェクトデータ

Biodiversidata, el Consorcio de Datos de Biodiversidad del Uruguay (https://biodiversidata.org/) tiene como objetivo reunir una base de datos primarios en constante crecimiento de la diversidad de especies del Uruguay y ponerla a disposición de manera abierta y accesible. En una primera etapa el trabajo se orientó a los datos de vertebrados (Grattarola et al. 2019). La segunda etapa de este proyecto está enfocada en la recolección de datos de plantas vasculares. Estos datos se publicarán en un data paper y posteriormente serán utilizados para responder una serie de preguntas científicas relativas a los patrones de distribución de las plantas en Uruguay. Las principales preguntas de investigación que estamos abordando son: i) ¿Dónde se encuentran los hotspots de biodiversidad en Uruguay? A nivel general y en los principales grupos de biodiversidad; ii) ¿Puede esta evidencia ser útil para redirigir las estrategias de conservación actuales?

タイトル Biodiversidata: Diversidad de especies de plantas vasculares en Uruguay
識別子 Biodiversidata_Plants
ファンデイング El proyecto Biodiversidata es coordinado por Florencia Grattarola con una beca de doctorado de la Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII) – Grant POS_EXT_2016_1_136663.
Study Area Description Abarca registros de presencia de especies en todo el territorio nacional.
研究の意図、目的、背景など（デザイン） Los datos de observaciones proporcionados por las/os integrantes de Biodiversidata fueron estandarizados e integrados a la base de datos del grupo de las plantas vasculares de Biodiversidata. El producto final consiste en una base de datos que incluye además datos extraídos de bibliografía y datos obtenidos a partir de bases de datos online. La base de datos general contiene tanto registros realizados durante el monitoreo de grupos específicos como registros de eventos de muestreo no sistemáticos. Los registros consisten principalmente en observaciones humanas y en algunos casos se colectaron especímenes que están preservados en colecciones de Uruguay.

プロジェクトに携わる要員:

Florencia Grattarola
  • 連絡先
http://orcid.org/0000-0001-8282-5732

収集方法

El conjunto de datos reúne observaciones hechas en muestreos sistemáticos y no sistemáticos por César Fagúndez-Pachón.

Study Extent 12 sitios distribuidos en los departamentos de Rocha, San José, Durazno y Río Negro en Uruguay, en 2003 y 2019en el período entre 2016 y 2019.
Quality Control Se chequearon errores en los nombres científicos, localización geográfica y fechas de muestreo. Se agregaron datos sobre la autoría de los nombres científicos y se completaron los rangos taxonómicos desde Reino hasta el rango infraespecífico, se incluyó el término ‘taxonRank’ con información sobre el nivel de detalle de cada taxón. Se asignó a cada registro el nivel administrativo de Departamento y se incorporaron datos sobre la incertidumbre y precisión de la localización geográfica. El código de R utilizado para la limpieza de datos está disponible en nuestro repositorio de GitHub (https://github.com/bienflorencia/rBiodiversidata).

Method step description:

  1. Verificación de errores ortográficos de nombres científicos usando los paquetes de R 'taxize' (Chamberlain et al. 2020) y 'WorldFlora' (Kindt 2020). Para verificar los nombres primero contrastamos la lista de especies con la referencia taxonómica de World Flora Online (WFO) (http://www.worldfloraonline.org/), si la especie o su sinónimo sugeridos por WFO fuera aceptado según Zuloaga et al. (2019) en Darwinion (http://www.darwin.edu.ar), conservamos el nombre y el ‘taxonID’ de WFO, de lo contrario, utilizamos el nombre de Darwinion y buscamos una ‘taxonID’ en Tropicos (https://www.tropicos.org/). El nombre original de la especie se mantuvo bajo el término ‘previousIdentifications’. La lista final de nombres científicos fue verificada por los expertos en plantas de Biodiversidata.
  2. Determinación de rangos taxonómicos superiores (Reino, Filo, Clase, Orden, Familia y Género), inclusión del término de rango infraespecífico y la autoridad taxonómica para los nombres científicos.
  3. Incorporación del término ‘establishmentMeans’ categorizando a las especies en nativas o introducidas según Andrade et al. (2018).
  4. Verificación de valores atípicos o inexactos en la localización geográfica. Incorporación de los campos de incertidumbre y precisión para los valores de latitud y longitud proporcionados.
  5. Estandarización del estado/provincia geográfica a través de la base de datos del GeoNames Gazetteer utilizando el paquete R 'geonames' (Rowlingson 2019). Inclusión de términos estándares para los rangos geográficos más altos que el nivel de localidad (continente y país).

書誌情報の引用

  1. Andrade BO, Marchesi E, Burkart S, Setubal RB, Lezama F, Perelman S, Schneider AA, Trevisan R, Overbeck GE, Boldrini II (2018) Vascular plant species richness and distribution in the Río de la Plata grasslands. Botanical Journal of the Linnean Society 188: 6. https://doi.org/10.1093/botlinnean/boy063
  2. Chamberlain S, Szoecs E, Foster Z, Arendsee Z, Boettiger C, Ram K, Bartomeus I, Baumgartner J, O'Donnell J, Oksanen J, Tzovaras BG, Marchand P, Tran V, Salmon M, Li G, Grenié M (2020) taxize: Taxonomic information from around the web. R package version 0.9.92. https://cran.r-project.org/web/packages/taxize
  3. Fagúndez C (2003) La vegetación de un blanqueal en el litoral oeste del Uruguay: efectos de la hormiga Atta vollenweideri Forel. Trabajo final de Licenciatura en ciencias biológicas, opción Botánica. Facultad de Ciencias, UdelaR, Montevideo-Uruguay. 28pp. http://www.guayubira.org.uy/monte/bibliografia/FagundezBlanqueal.pdf
  4. Grattarola F, Botto G, da Rosa I, Gobel N, González EM, González J, Hernández D, Laufer G, Maneyro R, Martínez-Lanfranco JA, Naya DE, Rodales AL, Ziegler L, Pincheira-Donoso D (2019) Biodiversidata: An Open-Access Biodiversity Database for Uruguay. Biodiversity Data Journal 7. https://doi.org/10.3897/BDJ.7.e36226
  5. Kindt R (2020) WorldFlora: An R package for exact and fuzzy matching of plant names against the World Flora Online Taxonomic Backbone data. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2020.02.02.930719
  6. Rowlingson B (2019) Interface to the "Geonames" Spatial Query Web Service. R package version 0.999. https://cran.r-project.org/web/packages/geonames/
  7. Zuloaga FO, Belgrano MJ, Zanotti CA (2019) Actualización del Catálogo de las Plantas Vasculares del Cono Sur. Darwiniana, nueva serie 7: 70. https://doi.org/10.14522/darwiniana.2019.72.861

追加のメタデータ

代替識別子 90a5be66-f51f-4a7e-9ffe-3137c7d3e0c3
https://cloud.gbif.org/lac/resource?r=plantas_cesarfagundez