Описание
We provide occurrence data of black flies (Diptera: Simuliidae) from Indonesia, Malaysia, Thailand, and Vietnam with corresponding DNA derived data. The black flies were collected by Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya, Malaysia, except black flies from Thailand. DNA barcodes based on mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene generated from the black fly samples are used to establish a database in GBIF. This project (BIFA6_017) is funded by the GBIF-BIFA program.
Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 284 записей.
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Low V L, Ya'cob Z, Putt Q Y, Izwan-Anas N, Hew Y X (2023). Black Flies (Diptera: Simuliidae) of South East Asia. Version 1.10. Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya. Occurrence dataset. https://cloud.gbif.org/asia/resource?r=black_flies_of_indonesia_malaysia_and_vietnam&v=1.10
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: c80987f7-f87a-4ae3-a2cc-ccd59bc951e8. Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Participant Node Managers Committee.
Ключевые слова
Occurrence; Simuliidae; Black Flies; Indonesia; Malaysia; Thailand; Vietnam; COI
Контакты
- Originator ●
- Point Of Contact
- Principal Investigator
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
- Point Of Contact
- Co-Principal Investigator
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
- Metadata Provider ●
- Originator ●
- Point Of Contact
- Graduate Student
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
- Metadata Provider ●
- Originator ●
- Point Of Contact
- Graduate Student
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
- Metadata Provider ●
- Originator ●
- Point Of Contact
- Graduate Student
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
- Point Of Contact
- Co Principal Investigator
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
Географический охват
The black fly samples were collected from different localities in Indonesia, Malaysia, Thailand and Vietnam.
| Ограничивающие координаты | Юг Запад [-10,401, 94,746], Север Восток [23,08, 141,592] |
|---|
Временной охват
| Дата начала / Дата окончания | 2010-12-29 / 2021-06-01 |
|---|
Данные проекта
This project will digitize black flies from Southeast Asia and seek to address taxonomic issues via DNA barcoding and metabarcoding approaches, providing a way forward for establishing a DNA barcode library for the family Simuliidae and long-term improvements and additions to black fly information in Southeast Asia.
| Название | DNA barcoding and taxonomic classification of black flies in Southeast Asia |
|---|---|
| Идентификатор | BIFA6_017 |
| Финансирование | Funded by Ministry of the Environment, Government of Japan; Co-funded by TIDREC, Universiti Malaya, Malaysia |
| Описание района исследования | Black flies collected from the Oriental Region (particularly Southeast Asia) belong to the genus Simulium. |
Исполнители проекта:
- Principal Investigator
- Principal Investigator
- Publisher
- Publisher
- Publisher
Методы сбора
Black fly samples collection was done at the accessible streams and rivers, whereby these are the breeding habitats for larvae and pupae of black flies. Pupae that attached on substrates such as leaves, stems, twigs, grasses and roots were collected using forceps. Then it will be kept alive individually in vials until adult emergence before being preserved in 80% ethanol for the identification process. The methods of collection and identification followed those of Takaoka (2003) and Adler et al. (2004).
| Охват исследования | All black fly samples were collected from flowing streams. |
|---|
Описание этапа методики:
- The study procedures are as follows: sample collection, sample identification, sample DNA extraction, PCR.
Данные коллекции
| Название коллекции | Institute of Biological Sciences (ISB), Faculty of Science, Universiti Malaya, Malaysia |
|---|
| Название коллекции | Black Fly Gallery, TIDREC, Universiti Malaya, Malaysia |
|---|
| Методы сохранения образцов | Alcohol |
|---|
Дополнительные метаданные
Black fly samples, except from Thailand, of this dataset are deposited in the laboratories of Institute of Biological Sciences and TIDREC, Universiti Malaya, Malaysia. Upon collection from study sites in Indonesia, Malaysia, and Vietnam, the black fly samples were indexed in the format of "Nation_Locality_Stream_# where collection occured_Vial_# where the sample from respective stream kept". For instance, the black fly sample from the first vial of stream 1, Lombok, Indonesia would be indexed as "IN_LB_S1V1". The black fly samples collected are individually preserved in 80% ETOH in a 2.0 mL tube and stored at -20 degree Celsius.
| Альтернативные идентификаторы | c80987f7-f87a-4ae3-a2cc-ccd59bc951e8 |
|---|---|
| https://cloud.gbif.org/asia/resource?r=black_flies_of_indonesia_malaysia_and_vietnam |