説明
We provide occurrence data of black flies (Diptera: Simuliidae) from Indonesia, Malaysia, Thailand, and Vietnam with corresponding DNA derived data. The black flies were collected by Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya, Malaysia, except black flies from Thailand. DNA barcodes based on mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene generated from the black fly samples are used to establish a database in GBIF. This project (BIFA6_017) is funded by the GBIF-BIFA program.
データ レコード
この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、284 レコードが含まれています。
この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。
バージョン
次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。
引用方法
研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:
Low V L, Ya'cob Z, Putt Q Y, Izwan-Anas N, Hew Y X (2023). Black Flies (Diptera: Simuliidae) of South East Asia. Version 1.10. Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya. Occurrence dataset. https://cloud.gbif.org/asia/resource?r=black_flies_of_indonesia_malaysia_and_vietnam&v=1.10
権利
研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:
パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.
GBIF登録
このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: c80987f7-f87a-4ae3-a2cc-ccd59bc951e8が割り当てられています。 Participant Node Managers Committee によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているTropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya が、このリソースをパブリッシュしました。
キーワード
Occurrence; Simuliidae; Black Flies; Indonesia; Malaysia; Thailand; Vietnam; COI
連絡先
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- Principal Investigator
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
- 連絡先
- Co-Principal Investigator
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
- メタデータ提供者 ●
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- Graduate Student
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
- メタデータ提供者 ●
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- Graduate Student
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
- メタデータ提供者 ●
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- Graduate Student
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
- 連絡先
- Co Principal Investigator
- Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
地理的範囲
The black fly samples were collected from different localities in Indonesia, Malaysia, Thailand and Vietnam.
座標(緯度経度) | 南 西 [-10.401, 94.746], 北 東 [23.08, 141.592] |
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時間的範囲
開始日 / 終了日 | 2010-12-29 / 2021-06-01 |
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プロジェクトデータ
This project will digitize black flies from Southeast Asia and seek to address taxonomic issues via DNA barcoding and metabarcoding approaches, providing a way forward for establishing a DNA barcode library for the family Simuliidae and long-term improvements and additions to black fly information in Southeast Asia.
タイトル | DNA barcoding and taxonomic classification of black flies in Southeast Asia |
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識別子 | BIFA6_017 |
ファンデイング | Funded by Ministry of the Environment, Government of Japan; Co-funded by TIDREC, Universiti Malaya, Malaysia |
Study Area Description | Black flies collected from the Oriental Region (particularly Southeast Asia) belong to the genus Simulium. |
プロジェクトに携わる要員:
- 研究代表者
- 研究代表者
- データ公開者
- データ公開者
- データ公開者
収集方法
Black fly samples collection was done at the accessible streams and rivers, whereby these are the breeding habitats for larvae and pupae of black flies. Pupae that attached on substrates such as leaves, stems, twigs, grasses and roots were collected using forceps. Then it will be kept alive individually in vials until adult emergence before being preserved in 80% ethanol for the identification process. The methods of collection and identification followed those of Takaoka (2003) and Adler et al. (2004).
Study Extent | All black fly samples were collected from flowing streams. |
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Method step description:
- The study procedures are as follows: sample collection, sample identification, sample DNA extraction, PCR.
コレクションデータ
コレクション名 | Institute of Biological Sciences (ISB), Faculty of Science, Universiti Malaya, Malaysia |
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コレクション名 | Black Fly Gallery, TIDREC, Universiti Malaya, Malaysia |
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標本保存方法 | Alcohol |
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追加のメタデータ
Black fly samples, except from Thailand, of this dataset are deposited in the laboratories of Institute of Biological Sciences and TIDREC, Universiti Malaya, Malaysia. Upon collection from study sites in Indonesia, Malaysia, and Vietnam, the black fly samples were indexed in the format of "Nation_Locality_Stream_# where collection occured_Vial_# where the sample from respective stream kept". For instance, the black fly sample from the first vial of stream 1, Lombok, Indonesia would be indexed as "IN_LB_S1V1". The black fly samples collected are individually preserved in 80% ETOH in a 2.0 mL tube and stored at -20 degree Celsius.
代替識別子 | c80987f7-f87a-4ae3-a2cc-ccd59bc951e8 |
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https://cloud.gbif.org/asia/resource?r=black_flies_of_indonesia_malaysia_and_vietnam |