Black Flies (Diptera: Simuliidae) of South East Asia

Registro biológico Espécimen
Última versión publicado por Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya el mar. 20, 2023 Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya
Inicio:
https://www.tidrec.com/
Fecha de publicación:
20 de marzo de 2023
Licencia:
CC-BY 4.0

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Descripción

We provide occurrence data of black flies (Diptera: Simuliidae) from Indonesia, Malaysia, Thailand, and Vietnam with corresponding DNA derived data. The black flies were collected by Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya, Malaysia, except black flies from Thailand. DNA barcodes based on mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene generated from the black fly samples are used to establish a database in GBIF. This project (BIFA6_017) is funded by the GBIF-BIFA program.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 284 registros.

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Low V L, Ya'cob Z, Putt Q Y, Izwan-Anas N, Hew Y X (2023). Black Flies (Diptera: Simuliidae) of South East Asia. Version 1.10. Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya. Occurrence dataset. https://cloud.gbif.org/asia/resource?r=black_flies_of_indonesia_malaysia_and_vietnam&v=1.10

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: c80987f7-f87a-4ae3-a2cc-ccd59bc951e8.  Tropical Infectious Diseases Research and Education Centre (TIDREC), Universiti Malaya publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Participant Node Managers Committee.

Palabras clave

Occurrence; Simuliidae; Black Flies; Indonesia; Malaysia; Thailand; Vietnam; COI

Contactos

Van Lun Low
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
  • Principal Investigator
TIDREC, Universiti Malaya
  • Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
50603 Kuala Lumpur
Wilayah Persekutuan Kuala Lumpur
MY
Zubaidah Ya'cob
  • Punto De Contacto
  • Co-Principal Investigator
TIDREC, Universiti Malaya
  • Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
50603 Kuala Lumpur
Wilayah Persekutuan Kuala Lumpur
MY
Qi Yan Putt
  • Proveedor De Los Metadatos ●
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
  • Graduate Student
TIDREC, Universiti Malaya
  • Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
50603 Kuala Lumpur
Wilayah Persekutuan Kuala Lumpur
MY
Noor Izwan-Anas
  • Proveedor De Los Metadatos ●
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
  • Graduate Student
TIDREC, Universiti Malaya
  • Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
50603 Kuala Lumpur
Wilayah Persekutuan Kuala Lumpur
MY
Yan Xin Hew
  • Proveedor De Los Metadatos ●
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
  • Graduate Student
TIDREC, Universiti Malaya
  • Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
50603 Kuala Lumpur
Wilayah Persekutuan Kuala Lumpur
MY
Zubaidah Ya'cob
  • Punto De Contacto
  • Co Principal Investigator
TIDREC, Universiti Malaya
  • Level 2, High Impact Research (HIR) Building, Universiti Malaya
50603 Kuala Lumpur
Wilayah Persekutuan Kuala Lumpur
MY

Cobertura geográfica

The black fly samples were collected from different localities in Indonesia, Malaysia, Thailand and Vietnam.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-10,401, 94,746], Latitud Máxima Longitud Máxima [23,08, 141,592]

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2010-12-29 / 2021-06-01

Datos del proyecto

This project will digitize black flies from Southeast Asia and seek to address taxonomic issues via DNA barcoding and metabarcoding approaches, providing a way forward for establishing a DNA barcode library for the family Simuliidae and long-term improvements and additions to black fly information in Southeast Asia.

Título DNA barcoding and taxonomic classification of black flies in Southeast Asia
Identificador BIFA6_017
Fuentes de Financiación Funded by Ministry of the Environment, Government of Japan; Co-funded by TIDREC, Universiti Malaya, Malaysia
Descripción del área de estudio Black flies collected from the Oriental Region (particularly Southeast Asia) belong to the genus Simulium.

Personas asociadas al proyecto:

Van Lun Low
  • Investigador Principal
Zubaidah Ya'cob
  • Investigador Principal
Noor Izwan-Anas
  • Publicador
Yan Xin Hew
  • Publicador
Qi Yan Putt
  • Publicador

Métodos de muestreo

Black fly samples collection was done at the accessible streams and rivers, whereby these are the breeding habitats for larvae and pupae of black flies. Pupae that attached on substrates such as leaves, stems, twigs, grasses and roots were collected using forceps. Then it will be kept alive individually in vials until adult emergence before being preserved in 80% ethanol for the identification process. The methods of collection and identification followed those of Takaoka (2003) and Adler et al. (2004).

Área de Estudio All black fly samples were collected from flowing streams.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. The study procedures are as follows: sample collection, sample identification, sample DNA extraction, PCR.

Datos de la colección

Nombre de la Colección Institute of Biological Sciences (ISB), Faculty of Science, Universiti Malaya, Malaysia
Nombre de la Colección Black Fly Gallery, TIDREC, Universiti Malaya, Malaysia
Métodos de preservación de los ejemplares Alcohol

Metadatos adicionales

Black fly samples, except from Thailand, of this dataset are deposited in the laboratories of Institute of Biological Sciences and TIDREC, Universiti Malaya, Malaysia. Upon collection from study sites in Indonesia, Malaysia, and Vietnam, the black fly samples were indexed in the format of "Nation_Locality_Stream_# where collection occured_Vial_# where the sample from respective stream kept". For instance, the black fly sample from the first vial of stream 1, Lombok, Indonesia would be indexed as "IN_LB_S1V1". The black fly samples collected are individually preserved in 80% ETOH in a 2.0 mL tube and stored at -20 degree Celsius.

Identificadores alternativos c80987f7-f87a-4ae3-a2cc-ccd59bc951e8
https://cloud.gbif.org/asia/resource?r=black_flies_of_indonesia_malaysia_and_vietnam