Description
Data Records
The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 51 records.
This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.
Versions
The table below shows only published versions of the resource that are publicly accessible.
Rights
Researchers should respect the following rights statement:
This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.
GBIF Registration
This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: a0a47a2c-2c41-4a7f-975f-d67b39166992. BoL-UY publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by GBIF Uruguay.
Keywords
Occurrence; plantas con flor; melíferas; tipificación; bosque nativo; Specimen
Contacts
- Metadata Provider ●
- Originator ●
- Point Of Contact
- Investigador
https://orcid.org/0000-0001-7734-8679
- Originator
- Docente
- Originator
- Profesora
- Originator
- Director
- Custodian Steward
- Gestión de la Información
- Investigador
- Processor
- Coordinadora
- Custodian Steward
- Gestión de la Información
Geographic Coverage
Ambientes naturales y urbanos de la región norte de Uruguay
| Bounding Coordinates | South West [-31.208, -55.985], North East [-30.868, -55.387] |
|---|
Taxonomic Coverage
N/A
| Kingdom | Plantae |
|---|---|
| Phylum | Tracheophyta |
| Class | Magnoliopsida |
| Order | Celastrales, Malvales, Santalales, Boraginales, Lamiales, Asterales, Aquifoliales, Rosales, Fabales, Solanales, Sapindales, Gentianales, Laurales, Malpighiales, Oxalidales, Myrtales, Apiales |
| Family | Loranthaceae, Rubiaceae, Lamiaceae, Oxalidaceae, Fabaceae, Myrtaceae, Cardiopteridaceae, Thymelaeaceae, Scrophulariaceae, Boraginaceae, Anacadiaceae, Rhamnaceae, Lauraceae, Sapindaceae, Verbenaceae, Rosaceae, Orobranchaceae, Rutaceae, Apiaceae, Bignoniaceae, Solanaceae, Celastraceae, Asteraceae, Salicaceae, Euphorbiaceae, Quillajaceae |
Temporal Coverage
| Start Date / End Date | 2021-01-10 / 2022-12-02 |
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Project Data
El objetivo del proyecto es clasificar el origen floral de las mieles del norte de Uruguay utilizando ADN metabarcoding como una alternativa a la técnica tradicional de melisopalinología (identificación taxonómica basada en la morfología del polen). Este enfoque busca agregar valor a los productos obtenidos por los apicultores locales a través de la certificación del origen y la composición floral del polen presente en la miel producida en plantaciones de Eucalipto, bosques nativos y pastizales cultivados de Lotus. Utilizando la plataforma de secuenciación masiva Ion Torrent, el equipo ha caracterizado la flora presente en las cercanías de los apiarios de los cuales provienen las mieles mencionadas, y ha recolectado muestras para herbario y tejidos para la codificación de ADN.
| Title | Tipificación botánica de las mieles uruguayas usando ADN metabarcoding |
|---|---|
| Funding | Consejo de Formación en Educación, Administración Nacional de Educación Pública, Uruguay |
| Study Area Description | Bosque nativo, Plantaciones de Eucalyptus y pasturas de Lotus, cultivados del norte de Uruguay |
| Design Description | Los especímenes obtenidos para generar los vouchers fueron recolectados en un radio de 1 km de distancia teniendo como centro el apiario donde se realizó el análisis de DNA metabarcoding |
The personnel involved in the project:
- Author
Sampling Methods
Se obtuvieron muestras de hojas frescas de plantas melíferas en los alrededores de los apiarios utilizados para el análisis de la miel mediante ADN metabarcoding. Las hojas fueron procesadas en laboratorio para extraer ADN, amplificar un fragmento del gen trnL mediante PCR, y secuenciar el fragmento mediante Sanger.
| Study Extent | Tres localidades en bosques nativos, plantaciones de Eucalipto y pastizales cultivados de Lotus en los departamentos de Rivera y Treinta y Tres, entre enero de 2021 y diciembre de 2022. |
|---|---|
| Quality Control | Se mejoró el id de la ocurrencia, agregándole la institución y una referencia al tema del conjunto de datos. Se estableció el estado del voucher y el estadío en que estaba la planta al momento de colecta, guiándose por las imágenes de los vouchers. Se chequeó el formato de las fechas y se corroboró la localización geográfica de los registros. |
Method step description:
- Se incluyó el enlace a las secuencias en Genbank de los especímenes con secuencias en el campo associatedSequences.
- Se ingresó las imágenes de los especímenes con fotografía a Wikimedia usando OpenRefine bajo la categoría "Files_provided_by_Uruguayan_Barcode_of_Life_Initiative_BoL-UY" y se incluyó el enlace a la fotografía en el campo associatedMedia.
- Se ingresó la precisión de las coordenadas y se estimó la incertidumbre en 10 metros. En los casos en que las coordenadas fueron medidas en Google Earth, la incertidubre se estimó en 100m.
- Se realizó un chequeo contra la lista de especies prioritarias (Soutullo et al., 2013) y se siguió el protocolo para determinar si correspondía “oscurecer” las coordenadas Chapman (2020).
Collection Data
| Collection Name | Herbario Bernardo Rosengurtt |
|---|---|
| Collection Identifier | https://scientific-collections.gbif.org/collection/2c46f767-ed9b-4a04-a85c-2b577b5d08ad |
| Specimen preservation methods | Dried and pressed |
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Bibliographic Citations
- Soutullo A, Clavijo C & Martínez-Lanfranco JA (2013) Especies Prioritarias Para La Conservación En Uruguay. Vertebrados, Moluscos Continentales y Plantas Vasculares. Montevideo: SNAP/DINAMA/MVOTMA and DICYT/MEC.
- Chapman AD (2020) Buenas prácticas actuales para generalizar datos de especies sensibles. Copenhagen: GBIF Secretariat. https://doi.org/10.15468/doc-5jp4-5g10
Additional Metadata
Este recurso fue creado en el marco de la Iniciativa Uruguaya de Código de Barras de la Vida (*), un consorcio de instituciones uruguayas –en formación- que tiene el propósito de aplicar la técnica de Barcoding para generar la base molecular de referencia para la identificación de las especies y unidades taxonómicas que ocurren en Uruguay así como fomentar su uso y sistematizar los datos en referencia a ellas. *https://www.gub.uy/ministerio-educacion-cultura/politicas-y-gestion/usina-codigos-barra-vida-uruguay
| Alternative Identifiers | https://cloud.gbif.org/uy/resource?r=meliferas_cenur |
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