Anfibios y Reptiles del Centro Universitario Regional Noreste (UdelaR)

Occurrence Specimen
Latest version published by Biodiversidata on Mar 21, 2025 Biodiversidata
Home:
https://biodiversidata.org/
Publication date:
21 March 2025
Published by:
Biodiversidata
License:
CC-BY 4.0

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Description

El conjunto de datos contiene datos primarios de especímenes de anfibios y reptiles depositados en la Colección de Vertebrados del Centro Universitario Regional Noreste Sede Rivera de la Universidad de la República. Incluye 697 especímenes recolectados en salidas de campo y muestreos no estandarizados, entre el 2009 y el 2019 a lo largo del territorio de Uruguay y en el sur de Brasil.

Data Records

The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 697 records.

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versions

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How to cite

Researchers should cite this work as follows:

Camargo A, Sensseber M, Grattarola F (2025). Anfibios y Reptiles del Centro Universitario Regional Noreste (UdelaR). Version 1.3. Biodiversidata. Occurrence dataset. https://cloud.gbif.org/uy/resource?r=data_cur_noreste&v=1.3

Rights

Researchers should respect the following rights statement:

This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF Registration

This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: 8f84e304-9f33-4e4d-becc-f178154fd2ff.  Biodiversidata publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by GBIF Uruguay.

Keywords

Occurrence; Specimen; Uruguay; Anfibios; Reptiles

Contacts

Arley Camargo
  • Content Provider ●
  • Originator ●
  • Point Of Contact ●
  • Principal Investigator
  • Profesor Adjunto
Centro Universitario Regional Noreste, Sede Rivera - Universidad de la República
Rivera
Rivera
UY
Mateo Sensseber
  • Content Provider ●
  • Originator ●
  • Processor
  • Estudiante de Grado
Centro Universitario Regional Noreste, Sede Rivera - Universidad de la República
Rivera
Rivera
UY
Florencia Grattarola
  • Metadata Provider ●
  • Originator ●
  • Distributor ●
  • Point Of Contact
  • Coordinadora y Data Manager
Biodiversidata
UY

Geographic Coverage

Los datos tienen una cobertura geográfica que incluye 171 localidades de 16 departamentos de Uruguay y 4 localidades del estado de Rio Grande do Sul en Brasil.

Bounding Coordinates South West [-34.779, -58.292], North East [-29.409, -49.786]

Taxonomic Coverage

El conjunto de datos reune un total de 32 especies de anfibios (6 familias) y 20 especies de reptiles (11 familias).

Class Amphibia (Anfibios), Reptilia (Reptiles)
Family Alsodidae, Bufonidae, Hylidae, Leptodactylidae, Microhylidae, Odontophrynidae, Amphisbaenidae, Colubridae, Diploglossidae, Dipsadidae, Gekkonidae, Gymnophthalmidae, Leptotyphlopidae, Phyllodactylidae, Teiidae, Tropiduridae, Viperidae

Temporal Coverage

Start Date / End Date 2009-01-09 / 2019-12-10

Project Data

Biodiversidata, el Consorcio de Datos de Biodiversidad del Uruguay, fue creado en 2018 por Florencia Grattarola como parte de su proyecto de doctorado. Su plataforma de acceso abierto (https://biodiversidata.org/) tiene como objetivo reunir una base de datos primarios en constante crecimiento de la diversidad de especies del Uruguay y ponerla a disposición de manera abierta y accesible. Las principales preguntas de investigación que se abordan en esta iniciativa son: i) ¿Dónde se encuentran los hotspots de biodiversidad en Uruguay? A nivel general y en los principales grupos de biodiversidad; ii) ¿Puede esta evidencia ser útil para redirigir las estrategias de conservación actuales?

Title Biodiversidata
Identifier Tetrapods
Funding El proyecto Biodiversidata es coordinado por Florencia Grattarola con una beca de doctorado de la Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII) – Grant POS_EXT_2016_1_136663
Study Area Description Los conjuntos de datos colectados en el marco de este proyecto abarcan registros de presencia de especies documentados en todo el territorio de Uruguay.
Design Description Los datos de observaciones proporcionados por las/os integrantes de Biodiversidata fueron estandarizados e integrados a la base de datos de Biodiversidata. El producto final incluye además datos extraídos de bibliografía y datos obtenidos a partir de bases de datos online. Contiene tanto registros realizados durante el monitoreo de grupos específicos como registros de eventos de muestreo no sistemáticos. Los registros consisten principalmente en observaciones humanas y en algunos casos se colectaron especímenes que están preservados en colecciones de Uruguay.

The personnel involved in the project:

Florencia Grattarola
  • Principal Investigator

Sampling Methods

Los registros son especímenes recolectados mediante diferentes técnicas como captura manual y trampas de caída, que luego fueron fijados en formol y preservados en etanol 70%. La gran mayoría de las georeferencias provienen de coordenadas geográficas tomadas mediante GPS, y secundariamente, mediante localización de puntos de muestreo en Google Earth. También en la mayoría de los casos los registros corresponden a campañas de muestreo para tesis y pasantías de investigación de grado y posgrado.

Study Extent El conjunto de datos incluye 697 especímenes colectados en localidades de Uruguay en el estado de Rio Grande do Sul en Brasil, en el período entre enero de 2009 y diciembre de 2019.
Quality Control Se chequearon errores en los nombres científicos, localización geográfica y fechas. Se agregaron datos sobre la autoría de los nombres científicos de las especies y se completaron los rangos taxonómicos desde Reino hasta el rango infraespecífico, se incluyó el término de rango taxonómico según el nivel de detalle de la especie. Se asignó a cada registro el nivel administrativo de Estado/Provincia y se incorporaron datos sobre la incertidumbre y precisión de la localización geográfica. El código de R utilizado para la limpieza de datos está disponible en nuestro repositorio de GitHub (https://github.com/bienflorencia/rBiodiversidata).

Method step description:

  1. Chequeo de nombres científicos. Verificación de errores ortográficos en los nombres científicos usando los paquetes de R 'taxize' (Chamberlain et al. 2020) y actualización de nombres científicos de acuerdo a Amphibian Species of the World (Frost 2021). El nombre original de la especie se mantuvo bajo el término "previousIdentifications".
  2. Recuperación completa de rangos taxonómicos superiores, inclusión del término de rango infraespecífico y la autoridad taxonómica para los nombres científicos.
  3. Verificación de errores o valores atípicos o inexactos en la localización geográfica. Incorporación de los campos de incertidumbre y precisión para los valores de latitud y longitud proporcionados.
  4. Identificación del estado/provincia geográfica a través de la base de datos del GeoNames Gazetteer utilizando el paquete R 'geonames' (Rowlingson 2019). Inclusión de términos estándares para los rangos geográficos más altos que el nivel de localidad (continente y país).

Collection Data

Collection Name Colección de Anfibios y Reptiles del Centro Universitario Regional Noreste, Sede Rivera (Udelar)
Collection Identifier CURCR
Parent Collection Identifier CURC
Collection Name Colección de Anfibios y Reptiles del Centro Universitario Regional Noreste, Sede Rivera (Udelar)
Collection Identifier CURCB
Parent Collection Identifier CURC
Specimen preservation methods Alcohol

Bibliographic Citations

  1. Chamberlain S, Szoecs E, Foster Z, Arendsee Z, Boettiger C, Ram K, Bartomeus I, Baumgartner J, O'Donnell J, Oksanen J, Tzovaras BG, Marchand P, Tran V, Salmon M, Li G, Grenié M (2020). taxize: Taxonomic information from around the web. R package version 0.9.98. https://github.com/ropensci/taxize
  2. Frost DR (2021). Amphibian Species of the World: an online reference. Version 6.1 (2021-07-14). American Museum of Natural History, New York, USA. https://amphibiansoftheworld.amnh.org/index.php
  3. Grattarola F (2021). rBiodiversidata: R Scripts. Zenodo, version 2.0. https://doi.org/10.5281/zenodo.2642135
  4. Rowlingson B (2019). geonames: Interface to the "Geonames" Spatial Query Web Service. R package version 0.999. https://CRAN.R-project.org/package=geonames

Additional Metadata

Alternative Identifiers 8f84e304-9f33-4e4d-becc-f178154fd2ff
https://cloud.gbif.org/uy/resource?r=data_cur_noreste