Plantas Vasculares del Uruguay (Observaciones Urtado et al.)

Registros biológicos
Última versión publicado por Biodiversidata el jul. 13, 2020 Biodiversidata
Inicio:
Enlace
Fecha de publicación:
13 de julio de 2020
Publicado por:
Biodiversidata
Licencia:
CC-BY 4.0

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Descripción

Este conjunto de datos contiene registros primarios de especies de plantas vasculares documentadas por Lucía Urtado, Florencia Rossi, Laura Cappuccio, Franco Teixeira de Mello y Patricia Mai en Uruguay, en el marco del proyecto ‘Adaptación de un índice de calidad de riberas para el monitoreo participativo del bosque ribereño en sistemas fluviales’, financiado por el Programa de Apoyo a la Investigación Estudiantil (PAIE-CSIC) de la Universidad de la República, Uruguay. Incluye 436 observaciones de 62 especies, realizadas en 2018, en el departamento de Maldonado. Estos datos forman parte de la base de datos de plantas vasculares de Biodiversidata, el Consorcio de Datos de Biodiversidad del Uruguay.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 436 registros.

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Urtado L, Rossi F, Cappuccio L, Teixeira de Mello F, Mai P, Grattarola F (2020): Plantas Vasculares del Uruguay (Observaciones Urtado et al.). v1.1. Biodiversidata. Dataset/Occurrence. https://cloud.gbif.org/lac/resource?r=plantas_maldonadocsic&v=1.1

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Biodiversidata. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: ce8285ae-97a7-4c14-9a88-4b4a490a0555.  Biodiversidata publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF Uruguay.

Palabras clave

Occurrence; Observation; Uruguay; Plantas Vasculares

Contactos

Lucía Urtado
  • Proveedor De Contenido
  • Originador
Estudiante de grado y responsable del Proyecto Estudiantil
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República
Maldonado
Maldonado
UY
Florencia Rossi
  • Proveedor De Contenido
  • Originador
Estudiante de grado
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República
Maldonado
Maldonado
UY
Laura Cappuccio
  • Proveedor De Contenido
  • Originador
Estudiante de grado
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República
Maldonado
Maldonado
UY
Franco Teixeira de Mello
  • Proveedor De Contenido
  • Originador
  • Punto De Contacto
Profesor Adjunto
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República
Maldonado
Maldonado
UY
Patricia Mai
  • Proveedor De Contenido
  • Originador
Profesora Asistente
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República
Maldonado
Maldonado
UY
Florencia Grattarola
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Custodio De Los Datos
  • Originador
  • Distribuidor
  • Punto De Contacto
Coordinadora y Data Manager
Biodiversidata
UY
Lucía Urtado
  • Proveedor De Contenido
  • Originador
Estudiante de grado
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República
Maldonado
Maldonado
UY

Cobertura geográfica

La cobertura geográfica incluye 29 sitios en el departamento de Maldonado, Uruguay.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-34,746, -55,082], Latitud Máxima Longitud Máxima [-34,509, -54,79]

Cobertura taxonómica

Se registraron un total de 62 especies de plantas vasculares (56 nativas), distribuidas en 32 familias y 48 géneros.

Filo Tracheophyta (Plantas Vasculares)
Class Magnoliopsida, Liliopsida, Polypodiopsida

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2018-04-24 / 2018-11-16

Datos del proyecto

Biodiversidata, el Consorcio de Datos de Biodiversidad del Uruguay (https://biodiversidata.org/) tiene como objetivo reunir una base de datos primarios en constante crecimiento de la diversidad de especies del Uruguay y ponerla a disposición de manera abierta y accesible. En una primera etapa el trabajo se orientó a los datos de vertebrados (Grattarola et al. 2019). La segunda etapa de este proyecto está enfocada en la recolección de datos de plantas vasculares. Estos datos se publicarán en un data paper y posteriormente serán utilizados para responder una serie de preguntas científicas relativas a los patrones de distribución de las plantas en Uruguay. Las principales preguntas de investigación que estamos abordando son: i) ¿Dónde se encuentran los hotspots de biodiversidad en Uruguay? A nivel general y en los principales grupos de biodiversidad; ii) ¿Puede esta evidencia ser útil para redirigir las estrategias de conservación actuales?

Título Biodiversidata: Diversidad de especies de plantas vasculares en Uruguay
Identificador Biodiversidata_Plants
Fuentes de Financiación El proyecto Biodiversidata es coordinado por Florencia Grattarola con una beca de doctorado de la Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII) – Grant POS_EXT_2016_1_136663.
Descripción del área de estudio Abarca registros de presencia de especies en todo el territorio nacional.
Descripción del diseño Los datos de observaciones proporcionados por las/os integrantes de Biodiversidata fueron estandarizados e integrados a la base de datos del grupo de las plantas vasculares de Biodiversidata. El producto final consiste en una base de datos que incluye además datos extraídos de bibliografía y datos obtenidos a partir de bases de datos online. La base de datos general contiene tanto registros realizados durante el monitoreo de grupos específicos como registros de eventos de muestreo no sistemáticos. Los registros consisten principalmente en observaciones humanas y en algunos casos se colectaron especímenes que están preservados en colecciones de Uruguay.

Personas asociadas al proyecto:

Florencia Grattarola

Métodos de muestreo

El diseño de muestreo se basó en la delimitación de tres transectos de 20 m paralelas a la línea de ribera, ubicadas cada 10 m, donde se empleó el Método de Cuadrantes Centrados. Se ubicaron 5 cuadrantes por transecta dispuestos cada 5 m. Para cada cuadrante se consideraron aquellos individuos arbóreos con más de 5 cm de diámetro de tronco a la altura del pecho y más de 1,30 m de altura. Se midió la distancia al punto medio del cuadrante; el diámetro a la altura del pecho (DAP) de las ramas principales, en el caso de los individuos ramificados desde la base, se sumaron los diámetros de las tres ramificaciones mayores y se identificó la especie. De forma complementaria se realizó un muestreo cualitativo de la vegetación, basado en el método de “caminamiento” el cual consiste en registrar las especies que se identifican en un tramo del arroyo. Para ello se destinó un tiempo de veinte minutos donde se recorrió 50 mts del arroyo en ambas márgenes. De esta forma se buscó ampliar el listado de especies. A los efectos de la propuesta, ambas metodologías fueron aplicadas en 12 de los 30 sitios; en los sitios restantes solo se realizó el muestreo cualitativo.

Área de Estudio El conjunto de datos reúne observaciones hechas en 29 sitios distribuidos en la cuenca del Arroyo Maldonado, entre la ruta 12 y la ruta 39 del Departamento de Maldonado, en el período entre abril y noviembre 2018.
Control de Calidad Se chequearon errores en los nombres científicos, localización geográfica y fechas de muestreo. Se agregaron datos sobre la autoría de los nombres científicos y se completaron los rangos taxonómicos desde Reino hasta el rango infraespecífico, se incluyó el término ‘taxonRank’ con información sobre el nivel de detalle de cada taxón. Se asignó a cada registro el nivel administrativo de Departamento y se incorporaron datos sobre la incertidumbre y precisión de la localización geográfica. El código de R utilizado para la limpieza de datos está disponible en nuestro repositorio de GitHub (https://github.com/bienflorencia/rBiodiversidata).

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Verificación de errores ortográficos de nombres científicos usando los paquetes de R 'taxize' (Chamberlain et al. 2020) y 'WorldFlora' (Kindt 2020). Para verificar los nombres primero contrastamos la lista de especies con la referencia taxonómica de World Flora Online (WFO) (http://www.worldfloraonline.org/), si la especie o su sinónimo sugeridos por WFO fuera aceptado según Zuloaga et al. (2019) en Darwinion (http://www.darwin.edu.ar), conservamos el nombre y el ‘taxonID’ de WFO, de lo contrario, utilizamos el nombre de Darwinion y buscamos una ‘taxonID’ en Tropicos (https://www.tropicos.org/). El nombre original de la especie se mantuvo bajo el término ‘previousIdentifications’. La lista final de nombres científicos fue verificada por los expertos en plantas de Biodiversidata.
  2. Determinación de rangos taxonómicos superiores (Reino, Filo, Clase, Orden, Familia y Género), inclusión del término de rango infraespecífico y la autoridad taxonómica para los nombres científicos.
  3. Incorporación del término ‘establishmentMeans’ categorizando a las especies en nativas o introducidas según Andrade et al. (2018).
  4. Verificación de valores atípicos o inexactos en la localización geográfica. Incorporación de los campos de incertidumbre y precisión para los valores de latitud y longitud proporcionados.
  5. Estandarización del estado/provincia geográfica a través de la base de datos del GeoNames Gazetteer utilizando el paquete R 'geonames' (Rowlingson 2019). Inclusión de términos estándares para los rangos geográficos más altos que el nivel de localidad (continente y país).

Referencias bibliográficas

  1. Andrade BO, Marchesi E, Burkart S, Setubal RB, Lezama F, Perelman S, Schneider AA, Trevisan R, Overbeck GE, Boldrini II (2018) Vascular plant species richness and distribution in the Río de la Plata grasslands. Botanical Journal of the Linnean Society 188: 6. https://doi.org/10.1093/botlinnean/boy063
  2. Chamberlain S, Szoecs E, Foster Z, Arendsee Z, Boettiger C, Ram K, Bartomeus I, Baumgartner J, O'Donnell J, Oksanen J, Tzovaras BG, Marchand P, Tran V, Salmon M, Li G, Grenié M (2020) taxize: Taxonomic information from around the web. R package version 0.9.92. https://cran.r-project.org/web/packages/taxize
  3. Grattarola F, Botto G, da Rosa I, Gobel N, González EM, González J, Hernández D, Laufer G, Maneyro R, Martínez-Lanfranco JA, Naya DE, Rodales AL, Ziegler L, Pincheira-Donoso D (2019) Biodiversidata: An Open-Access Biodiversity Database for Uruguay. Biodiversity Data Journal 7. https://doi.org/10.3897/BDJ.7.e36226
  4. Kindt R (2020) WorldFlora: An R package for exact and fuzzy matching of plant names against the World Flora Online Taxonomic Backbone data. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2020.02.02.930719
  5. Rowlingson B (2019) Interface to the "Geonames" Spatial Query Web Service. R package version 0.999. https://cran.r-project.org/web/packages/geonames/
  6. Zuloaga FO, Belgrano MJ, Zanotti CA (2019) Actualización del Catálogo de las Plantas Vasculares del Cono Sur. Darwiniana, nueva serie 7: 70. https://doi.org/10.14522/darwiniana.2019.72.861

Metadatos adicionales

Las personas involucradas fueron Lucía Urtado (responsable del proyecto), Florencia Rossi, Laura Cappuccio, Franco Teixeira de Mello (tutor), Patricia Mai (co-tutora). El proyecto contó con financiación del Programa de Apoyo a la Investigación Estudiantil de la Comisión Sectorial de Investigación Científica, Universidad de la República (PAIE-CSIC, UdelaR).

Propósito El proyecto ‘Adaptación de un índice de calidad de riberas para el monitoreo participativo del bosque ribereño en sistemas fluviales’, tuvo por objetivo la generación de un Índice de Calidad del bosque ribereño, para cuantificar de forma rápida el estado de conservación de estos ecosistemas, tomando en cuenta las características ambientales y de la vegetación para la cuenca del arroyo Maldonado, Uruguay.
Identificadores alternativos https://cloud.gbif.org/lac/resource?r=plantas_maldonadocsic