Plantas Vasculares del Uruguay (Observaciones Urtado et al.)

Latest version published by Biodiversidata on Jul 13, 2020 Biodiversidata

Este conjunto de datos contiene registros primarios de especies de plantas vasculares documentadas por Lucía Urtado, Florencia Rossi, Laura Cappuccio, Franco Teixeira de Mello y Patricia Mai en Uruguay, en el marco del proyecto ‘Adaptación de un índice de calidad de riberas para el monitoreo participativo del bosque ribereño en sistemas fluviales’, financiado por el Programa de Apoyo a la Investigación Estudiantil (PAIE-CSIC) de la Universidad de la República, Uruguay. Incluye 436 observaciones de 62 especies, realizadas en 2018, en el departamento de Maldonado. Estos datos forman parte de la base de datos de plantas vasculares de Biodiversidata, el Consorcio de Datos de Biodiversidad del Uruguay.

Data Records

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How to cite

Researchers should cite this work as follows:

Urtado L, Rossi F, Cappuccio L, Teixeira de Mello F, Mai P, Grattarola F (2020): Plantas Vasculares del Uruguay (Observaciones Urtado et al.). v1.1. Biodiversidata. Dataset/Occurrence. https://cloud.gbif.org/lac/resource?r=plantas_maldonadocsic&v=1.1

Rights

Researchers should respect the following rights statement:

The publisher and rights holder of this work is Biodiversidata. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF Registration

This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: ce8285ae-97a7-4c14-9a88-4b4a490a0555.  Biodiversidata publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by GBIF Uruguay.

Keywords

Occurrence; Observation; Uruguay; Plantas Vasculares

Contacts

Who created the resource:

Lucía Urtado
Estudiante de grado y responsable del Proyecto Estudiantil
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Florencia Rossi
Estudiante de grado
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Laura Cappuccio
Estudiante de grado
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Franco Teixeira de Mello
Profesor Adjunto
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Patricia Mai
Profesora Asistente
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
https://www.researchgate.net/profile/Patricia_Mai_Morente
Florencia Grattarola

Who can answer questions about the resource:

Florencia Grattarola
Lucía Urtado
Estudiante de grado y responsable del Proyecto Estudiantil
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Franco Teixeira de Mello
Profesor Adjunto
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY

Who filled in the metadata:

Florencia Grattarola

Who else was associated with the resource:

Content Provider
Lucía Urtado
Estudiante de grado
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Originator
Lucía Urtado
Estudiante de grado
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Content Provider
Florencia Rossi
Estudiante de grado
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Originator
Florencia Rossi
Estudiante de grado
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Content Provider
Laura Cappuccio
Estudiante de grado
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Originator
Laura Cappuccio
Estudiante de grado
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Content Provider
Franco Teixeira de Mello
Profesor Adjunto
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Originator
Franco Teixeira de Mello
Profesor Adjunto
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
Content Provider
Patricia Mai
Profesora Asistente
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
https://www.researchgate.net/profile/Patricia_Mai_Morente
Originator
Patricia Mai
Profesora Asistente
Centro Universitario Regional del Este (CURE), Universidad de la República Maldonado Maldonado UY
https://www.researchgate.net/profile/Patricia_Mai_Morente
Custodian Steward
Florencia Grattarola
Distributor
Florencia Grattarola

Geographic Coverage

La cobertura geográfica incluye 29 sitios en el departamento de Maldonado, Uruguay.

Bounding Coordinates South West [-34.746, -55.082], North East [-34.509, -54.79]

Taxonomic Coverage

Se registraron un total de 62 especies de plantas vasculares (56 nativas), distribuidas en 32 familias y 48 géneros.

Phylum  Tracheophyta (Plantas Vasculares)
Class  Magnoliopsida,  Liliopsida,  Polypodiopsida

Temporal Coverage

Start Date / End Date 2018-04-24 / 2018-11-16

Project Data

Biodiversidata, el Consorcio de Datos de Biodiversidad del Uruguay (https://biodiversidata.org/) tiene como objetivo reunir una base de datos primarios en constante crecimiento de la diversidad de especies del Uruguay y ponerla a disposición de manera abierta y accesible. En una primera etapa el trabajo se orientó a los datos de vertebrados (Grattarola et al. 2019). La segunda etapa de este proyecto está enfocada en la recolección de datos de plantas vasculares. Estos datos se publicarán en un data paper y posteriormente serán utilizados para responder una serie de preguntas científicas relativas a los patrones de distribución de las plantas en Uruguay. Las principales preguntas de investigación que estamos abordando son: i) ¿Dónde se encuentran los hotspots de biodiversidad en Uruguay? A nivel general y en los principales grupos de biodiversidad; ii) ¿Puede esta evidencia ser útil para redirigir las estrategias de conservación actuales?

Title Biodiversidata: Diversidad de especies de plantas vasculares en Uruguay
Identifier Biodiversidata_Plants
Funding El proyecto Biodiversidata es coordinado por Florencia Grattarola con una beca de doctorado de la Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII) – Grant POS_EXT_2016_1_136663.
Study Area Description Abarca registros de presencia de especies en todo el territorio nacional.
Design Description Los datos de observaciones proporcionados por las/os integrantes de Biodiversidata fueron estandarizados e integrados a la base de datos del grupo de las plantas vasculares de Biodiversidata. El producto final consiste en una base de datos que incluye además datos extraídos de bibliografía y datos obtenidos a partir de bases de datos online. La base de datos general contiene tanto registros realizados durante el monitoreo de grupos específicos como registros de eventos de muestreo no sistemáticos. Los registros consisten principalmente en observaciones humanas y en algunos casos se colectaron especímenes que están preservados en colecciones de Uruguay.

The personnel involved in the project:

Point Of Contact
Florencia Grattarola

Sampling Methods

El diseño de muestreo se basó en la delimitación de tres transectos de 20 m paralelas a la línea de ribera, ubicadas cada 10 m, donde se empleó el Método de Cuadrantes Centrados. Se ubicaron 5 cuadrantes por transecta dispuestos cada 5 m. Para cada cuadrante se consideraron aquellos individuos arbóreos con más de 5 cm de diámetro de tronco a la altura del pecho y más de 1,30 m de altura. Se midió la distancia al punto medio del cuadrante; el diámetro a la altura del pecho (DAP) de las ramas principales, en el caso de los individuos ramificados desde la base, se sumaron los diámetros de las tres ramificaciones mayores y se identificó la especie. De forma complementaria se realizó un muestreo cualitativo de la vegetación, basado en el método de “caminamiento” el cual consiste en registrar las especies que se identifican en un tramo del arroyo. Para ello se destinó un tiempo de veinte minutos donde se recorrió 50 mts del arroyo en ambas márgenes. De esta forma se buscó ampliar el listado de especies. A los efectos de la propuesta, ambas metodologías fueron aplicadas en 12 de los 30 sitios; en los sitios restantes solo se realizó el muestreo cualitativo.

Study Extent El conjunto de datos reúne observaciones hechas en 29 sitios distribuidos en la cuenca del Arroyo Maldonado, entre la ruta 12 y la ruta 39 del Departamento de Maldonado, en el período entre abril y noviembre 2018.
Quality Control Se chequearon errores en los nombres científicos, localización geográfica y fechas de muestreo. Se agregaron datos sobre la autoría de los nombres científicos y se completaron los rangos taxonómicos desde Reino hasta el rango infraespecífico, se incluyó el término ‘taxonRank’ con información sobre el nivel de detalle de cada taxón. Se asignó a cada registro el nivel administrativo de Departamento y se incorporaron datos sobre la incertidumbre y precisión de la localización geográfica. El código de R utilizado para la limpieza de datos está disponible en nuestro repositorio de GitHub (https://github.com/bienflorencia/rBiodiversidata).

Method step description:

  1. Verificación de errores ortográficos de nombres científicos usando los paquetes de R 'taxize' (Chamberlain et al. 2020) y 'WorldFlora' (Kindt 2020). Para verificar los nombres primero contrastamos la lista de especies con la referencia taxonómica de World Flora Online (WFO) (http://www.worldfloraonline.org/), si la especie o su sinónimo sugeridos por WFO fuera aceptado según Zuloaga et al. (2019) en Darwinion (http://www.darwin.edu.ar), conservamos el nombre y el ‘taxonID’ de WFO, de lo contrario, utilizamos el nombre de Darwinion y buscamos una ‘taxonID’ en Tropicos (https://www.tropicos.org/). El nombre original de la especie se mantuvo bajo el término ‘previousIdentifications’. La lista final de nombres científicos fue verificada por los expertos en plantas de Biodiversidata.
  2. Determinación de rangos taxonómicos superiores (Reino, Filo, Clase, Orden, Familia y Género), inclusión del término de rango infraespecífico y la autoridad taxonómica para los nombres científicos.
  3. Incorporación del término ‘establishmentMeans’ categorizando a las especies en nativas o introducidas según Andrade et al. (2018).
  4. Verificación de valores atípicos o inexactos en la localización geográfica. Incorporación de los campos de incertidumbre y precisión para los valores de latitud y longitud proporcionados.
  5. Estandarización del estado/provincia geográfica a través de la base de datos del GeoNames Gazetteer utilizando el paquete R 'geonames' (Rowlingson 2019). Inclusión de términos estándares para los rangos geográficos más altos que el nivel de localidad (continente y país).

Bibliographic Citations

  1. Andrade BO, Marchesi E, Burkart S, Setubal RB, Lezama F, Perelman S, Schneider AA, Trevisan R, Overbeck GE, Boldrini II (2018) Vascular plant species richness and distribution in the Río de la Plata grasslands. Botanical Journal of the Linnean Society 188: 6. https://doi.org/10.1093/botlinnean/boy063
  2. Chamberlain S, Szoecs E, Foster Z, Arendsee Z, Boettiger C, Ram K, Bartomeus I, Baumgartner J, O'Donnell J, Oksanen J, Tzovaras BG, Marchand P, Tran V, Salmon M, Li G, Grenié M (2020) taxize: Taxonomic information from around the web. R package version 0.9.92. https://cran.r-project.org/web/packages/taxize
  3. Grattarola F, Botto G, da Rosa I, Gobel N, González EM, González J, Hernández D, Laufer G, Maneyro R, Martínez-Lanfranco JA, Naya DE, Rodales AL, Ziegler L, Pincheira-Donoso D (2019) Biodiversidata: An Open-Access Biodiversity Database for Uruguay. Biodiversity Data Journal 7. https://doi.org/10.3897/BDJ.7.e36226
  4. Kindt R (2020) WorldFlora: An R package for exact and fuzzy matching of plant names against the World Flora Online Taxonomic Backbone data. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2020.02.02.930719
  5. Rowlingson B (2019) Interface to the "Geonames" Spatial Query Web Service. R package version 0.999. https://cran.r-project.org/web/packages/geonames/
  6. Zuloaga FO, Belgrano MJ, Zanotti CA (2019) Actualización del Catálogo de las Plantas Vasculares del Cono Sur. Darwiniana, nueva serie 7: 70. https://doi.org/10.14522/darwiniana.2019.72.861

Additional Metadata

Las personas involucradas fueron Lucía Urtado (responsable del proyecto), Florencia Rossi, Laura Cappuccio, Franco Teixeira de Mello (tutor), Patricia Mai (co-tutora). El proyecto contó con financiación del Programa de Apoyo a la Investigación Estudiantil de la Comisión Sectorial de Investigación Científica, Universidad de la República (PAIE-CSIC, UdelaR).

Purpose El proyecto ‘Adaptación de un índice de calidad de riberas para el monitoreo participativo del bosque ribereño en sistemas fluviales’, tuvo por objetivo la generación de un Índice de Calidad del bosque ribereño, para cuantificar de forma rápida el estado de conservación de estos ecosistemas, tomando en cuenta las características ambientales y de la vegetación para la cuenca del arroyo Maldonado, Uruguay.
Alternative Identifiers https://cloud.gbif.org/lac/resource?r=plantas_maldonadocsic